เรื่องราวของ สามพี่น้องตระ:Xล คันซาโตะ เป็นเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นในเมือง อายานางิ หลังจากเกิดเหตุการณ์ประหลาดเมื่อ 10 ปีก่อน(เป็นเหตุการณ์ที่เกิดหลังจากที่มินาโตะเสียสละตัวเองไปไม่นาน) ตัวเอกของเรื่อง คันซาโตะ ชิน และน้องชาย คันซาโตะ จุน ได้กลับมาที่เมืองอายานางิ หลังจากที่ไปอยู่กับญาติที่โตเกียวหลังเกิดเหตุการณ์ประหลาดเมื่อ 10 ปีก่อน(พ่อ แม่และน้องสาวเสียชีวิตจากเหตุการณ์นี้ด้วย) ทั้งสองได้กลับมาอยู่กับพี่ชายที่ห่างหายกันนานถึง 10 ปี หรือ คันซาโตะ เรียว ซึ่งเป็นหัวหน้าตำรวจทั้งที่ยังหนุ่มอยู่ และในช่วงนั้น ได้เกิดคดีสะเทือนขวัญ หรือ คดี Reverse พอดี ซึ่งมีเหยื่อที่เสียชีวิตแบบผิดปกติ(ผิวหนังด้านในถูกกลับออกมาอยู่ด้านนอก) และเกิดโรค Apathy Syndromeแบบไม่ทราบสาเหตุ ทำให้สองพี่น้อง คันซาโตะ ชิน และ คันซาโตะ จุน ที่ไม่รู้เรื่องราวอะไรเลยต้องพบกับกลุ่มคนที่มีสิ่งที่เรียกว่า Persona และองค์กรลึกลับที่ใช้ Persona ในการสังหารคน ทำให้พวกเขาต้องเข้าไปพัวพันกับเรื่องเหล่านั้นโดยที่ไม่ทันตั้งตัว