Dopo il drammatico confronto avvenuto nell'ultimo episodio della prima stagione, sia Chuck che Axe si trovano ad affrontare le conseguenze delle loro azioni.

Axe ha un duro scontro con un manager finanziario suo rivale. Chuck intanto prepara una squadra per un nuovo caso di alto profilo.

Axe prende in considerazione un nuovo importante affare. Nel frattempo anche Chuck dà inizio a un nuovo lavoro su un caso contro un titano del settore bancario.

Chuck deve sviluppare una nuova strategia per superare lo stallo del caso su cui sta lavorando. Intanto lui e Axe si incontrano per la prima volta dopo il loro confronto.

Chuck, Connerty e Sacker affidano il loro piano a un ansioso personaggio disposto a indossare una cimice. Intanto Axe fa un colpo veramente grosso.

Axe si trova a negoziare con un venditore importante ma troppo cauto. Intanto Wendy fa una scelta professionale che influenzerà il suo futuro con Chuck.

Mentre Chuck fa tesoro di una sua vittoria, Axe, dopo una battuta d'arresto, decide di creare una sala operativa per il futuro.

Axe investiga per capire chi ci sia dietro il fallimento del progetto Sandicot, ma incontra grandi difficoltà. Intanto Chuck scava nel privato di un suo rivale politico.

Ad Axe vengono inaspettatamente offerte delle informazioni utilissime. Chuck intanto arriva alla fine della sua indagine.

Axe deve affrontare un problema serio che coinvolge Lara e i ragazzi. Chuck valuta le ricadute che potrebbe avere una sua promozione politica.

Chuck si rende conto che nell'affare Ice Juice la posta in gioco è troppo alta. Intanto Axe fa una mossa azzardata, praticamente un passo verso il fallimento.

Nel finale della seconda stagione Axe riceve una novità del tutto inaspettata, mentre Chuck porta a compimento la sua paziente strategia...